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首頁 產(chǎn)品應用 技術知識 關于光合作用中的CO2響應曲線和光響應曲線的擬合軟件方法

關于光合作用中的CO2響應曲線和光響應曲線的擬合軟件方法

來源:北京力高泰科技有限公司 發(fā)布日期:2016-06-15 10:37:13 瀏覽次數(shù):7277

      氣體交換系統(tǒng)測量指標能夠告訴我們光合作用潛在的限制過程和誤差來源。研究最多的兩種光合作用響應曲線是A/Q(光響應曲線)和A/Ci(CO2響應曲線)。
 
光合作用光響應曲線
光合作用光響應曲線A/Q描述的是光強與光合生物凈光合速率間的關系,通過該曲線可以得出各種生理參數(shù)(表觀光量子效率(AQE)、最大凈光合速率(Pn)、光飽和點(LSP)、光補償點(LCP)、暗呼吸速率(Rd)等),這些參數(shù)是各種尺度植物生理生態(tài)學過程研究的基礎。
 
A/Ci響應曲線
A/Ci響應曲線是指在穩(wěn)定的葉片與空氣水蒸汽壓差下,光合速率和蒸騰速率隨CO2濃度的改變而變化的響應曲線。在飽和光強下,Rubisco酶的最大催化速率(Vc,max),RuBP的最大再生速率(Jmax)和磷酸丙糖的運輸速率(VTPU)被認為是限制光合作用的主要因素。Farquhar等人(1980)所提出的模型提供了一種通過A/Ci響應曲線(CO2響應曲線)來區(qū)分光合作用生化因素限制和氣孔因素限制的檢測方法?,F(xiàn)在,可通過同時檢測葉綠素熒光使這種分析方法進一步擴展得到一種活體檢測用于光合作用的能量和用于光呼吸的能量的方法,使得在葉肉中,生化限制因素和CO2擴散限制因素得以區(qū)分。
 


很多LI-6400/XT的用戶反饋:希望能有一個軟件來擬合光合的FvCB模型(Farquhar, von Caemmerer & Berry 1980)。實際上,有很多的文獻和方法使用該模型擬合曲線,但目前沒有專門的商業(yè)軟件包來實現(xiàn)這一功能。但是借用當前的一些免費統(tǒng)計軟件完全可以擬合光合FvCB模型,請見以下分享,用戶可以選擇這些模型來擬合自己的實驗數(shù)據(jù)。
 
但在此特別聲明:LI-COR公司及北京力高泰科技有限公司并沒有驗證過這些方法,請各位科研人員根據(jù)自己的實驗和經(jīng)驗去選擇適合您的模型!
 

使用FvCB模型擬合CO2響應曲線
同行評議的文獻
1.   Microsoft Excel 電子表格( Sharkey et al.)
地址:http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-3040.2007.01710.x/full

2.   SAS 程序(Dubois et al., 2007)
地址:http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1469- 8137.2007.02182.x/full

3.   基于網(wǎng)頁的詳盡的雙重優(yōu)化方法(Gu et al., 2010)
地址:http://leafweb.ornl.gov
 
其它擬合方法
1.   Microsoft Excel 電子表格- http://www.life.illinois.edu/bernacchi/links.html

2.   Microsoft Excel 電子表格 - http://landflux.org/Tools.php

3.   R 程序 - https://sites.google.com/site/fridleylab/home/protocols
 
擬合光響應曲線

同行評議的文獻
1.   Microsoft Excel 電子表格( Lobo et al.)
地址:http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11099-013-0045-y

其它擬合方法
1.   R 程序 - https://sites.google.com/site/fridleylab/home/protocols
2.   Microsoft Excel 電子表格 - http://landflux.org/Tools.php 

參考文獻
Farquhar G.D., Von Caemmerer S. & Berry J.A. (1980) A biochemical model of photosynthetic CO2 assimilation in leaves of C3 species. Planta 149, 78–90.

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